Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ptchd1Q14B62 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ptchd1Q14B62 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ptchd1Q14B62 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ptchd1Q14B62 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ptchd1Q14B62 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms