Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp2b3Q0VF55 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp2b3Q0VF55 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp2b3Q0VF55 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp2b3Q0VF55 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp2b3Q0VF55 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp2b3Q0VF55 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp2b3Q0VF55 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp2b3Q0VF55 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp2b3Q0VF55 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp2b3Q0VF55 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp2b3Q0VF55 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp2b3Q0VF55 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp2b3Q0VF55 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Atp2b3Q0VF55 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp2b3Q0VF55 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp2b3Q0VF55 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp2b3Q0VF55 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b3Q0VF55 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b3Q0VF55 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp2b3Q0VF55 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp2b3Q0VF55 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms