Protein–RNA interactions for Protein: Q0EEE2

Ptchd3, Patched domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd3Q0EEE2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptchd3Q0EEE2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptchd3Q0EEE2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptchd3Q0EEE2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptchd3Q0EEE2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms