Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc7a1Q09143 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc7a1Q09143 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slc7a1Q09143 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc7a1Q09143 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc7a1Q09143 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms