Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700061G19RikQ08EE8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700061G19RikQ08EE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700061G19RikQ08EE8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700061G19RikQ08EE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms