Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cass4Q08EC4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cass4Q08EC4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cass4Q08EC4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms