Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxc4Q08624 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc4Q08624 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc4Q08624 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc4Q08624 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc4Q08624 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc4Q08624 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms