Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnn2Q08093 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnn2Q08093 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnn2Q08093 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnn2Q08093 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms