Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ebf1Q07802 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ebf1Q07802 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ebf1Q07802 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ebf1Q07802 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ebf1Q07802 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms