Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col9a2Q07643 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col9a2Q07643 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col9a2Q07643 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col9a2Q07643 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col9a2Q07643 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col9a2Q07643 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col9a2Q07643 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col9a2Q07643 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col9a2Q07643 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col9a2Q07643 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col9a2Q07643 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col9a2Q07643 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col9a2Q07643 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col9a2Q07643 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col9a2Q07643 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col9a2Q07643 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col9a2Q07643 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col9a2Q07643 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col9a2Q07643 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col9a2Q07643 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col9a2Q07643 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col9a2Q07643 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col9a2Q07643 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col9a2Q07643 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col9a2Q07643 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms