Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Larp7Q05CL8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Larp7Q05CL8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Larp7Q05CL8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Larp7Q05CL8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Larp7Q05CL8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.7 ms