Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Fmn1Q05860 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Fmn1Q05860 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Fmn1Q05860 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Fmn1Q05860 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Fmn1Q05860 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Fmn1Q05860 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Fmn1Q05860 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Fmn1Q05860 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Fmn1Q05860 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Fmn1Q05860 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Fmn1Q05860 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Fmn1Q05860 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Fmn1Q05860 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Fmn1Q05860 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Fmn1Q05860 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Fmn1Q05860 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Fmn1Q05860 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Fmn1Q05860 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Fmn1Q05860 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Fmn1Q05860 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
Fmn1Q05860 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Fmn1Q05860 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Fmn1Q05860 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Fmn1Q05860 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Fmn1Q05860 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Fmn1Q05860 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Fmn1Q05860 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Fmn1Q05860 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
Fmn1Q05860 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Fmn1Q05860 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Fmn1Q05860 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Fmn1Q05860 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Fmn1Q05860 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Fmn1Q05860 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Fmn1Q05860 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Fmn1Q05860 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Fmn1Q05860 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Fmn1Q05860 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Fmn1Q05860 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Fmn1Q05860 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Fmn1Q05860 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms