Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoc2Q05020 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apoc2Q05020 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apoc2Q05020 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apoc2Q05020 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms