Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RelbQ04863 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RelbQ04863 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RelbQ04863 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RelbQ04863 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RelbQ04863 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RelbQ04863 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RelbQ04863 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RelbQ04863 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RelbQ04863 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RelbQ04863 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelbQ04863 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RelbQ04863 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelbQ04863 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RelbQ04863 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelbQ04863 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RelbQ04863 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelbQ04863 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelbQ04863 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelbQ04863 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RelbQ04863 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms