Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcad1Q04692 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcad1Q04692 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcad1Q04692 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcad1Q04692 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcad1Q04692 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms