Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epha4Q03137 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha4Q03137 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha4Q03137 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Epha4Q03137 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Epha4Q03137 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms