Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Nucb1Q02819 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Nucb1Q02819 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Nucb1Q02819 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Nucb1Q02819 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Nucb1Q02819 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Nucb1Q02819 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Nucb1Q02819 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Nucb1Q02819 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,7 ms