Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mc1rQ01727 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mc1rQ01727 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mc1rQ01727 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mc1rQ01727 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mc1rQ01727 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mc1rQ01727 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mc1rQ01727 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mc1rQ01727 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mc1rQ01727 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mc1rQ01727 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mc1rQ01727 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mc1rQ01727 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms