Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Gja5Q01231 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Gja5Q01231 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Gja5Q01231 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Gja5Q01231 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gja5Q01231 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gja5Q01231 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Gja5Q01231 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Gja5Q01231 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gja5Q01231 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Gja5Q01231 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Gja5Q01231 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,1 ms