Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Gja5Q01231 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gja5Q01231 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gja5Q01231 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gja5Q01231 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gja5Q01231 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gja5Q01231 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gja5Q01231 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Gja5Q01231 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms