Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde1bQ01065 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Pde1bQ01065 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde1bQ01065 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde1bQ01065 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pde1bQ01065 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde1bQ01065 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms