Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rbp4Q00724 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbp4Q00724 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp4Q00724 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp4Q00724 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbp4Q00724 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms