Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmb4P99026 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psmb4P99026 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmb4P99026 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmb4P99026 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmb4P99026 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms