Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp9bP98195 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp9bP98195 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp9bP98195 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atp9bP98195 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp9bP98195 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp9bP98195 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp9bP98195 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp9bP98195 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp9bP98195 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp9bP98195 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms