Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cds1P98191 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cds1P98191 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cds1P98191 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cds1P98191 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cds1P98191 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cds1P98191 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cds1P98191 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cds1P98191 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cds1P98191 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cds1P98191 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cds1P98191 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cds1P98191 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cds1P98191 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cds1P98191 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cds1P98191 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cds1P98191 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cds1P98191 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cds1P98191 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cds1P98191 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cds1P98191 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cds1P98191 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cds1P98191 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cds1P98191 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cds1P98191 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cds1P98191 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cds1P98191 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cds1P98191 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cds1P98191 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cds1P98191 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cds1P98191 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms