Protein–RNA interactions for Protein: P98086

C1qa, Complement C1q subcomponent subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qaP98086 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qaP98086 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qaP98086 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qaP98086 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qaP98086 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qaP98086 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qaP98086 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qaP98086 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qaP98086 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qaP98086 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qaP98086 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qaP98086 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qaP98086 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qaP98086 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qaP98086 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qaP98086 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qaP98086 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qaP98086 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qaP98086 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qaP98086 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qaP98086 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qaP98086 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qaP98086 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qaP98086 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qaP98086 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qaP98086 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qaP98086 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qaP98086 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1qaP98086 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1qaP98086 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1qaP98086 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1qaP98086 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1qaP98086 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1qaP98086 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1qaP98086 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1qaP98086 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1qaP98086 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1qaP98086 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1qaP98086 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1qaP98086 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1qaP98086 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1qaP98086 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1qaP98086 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1qaP98086 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1qaP98086 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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