Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npas2P97460 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npas2P97460 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npas2P97460 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npas2P97460 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npas2P97460 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npas2P97460 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npas2P97460 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Npas2P97460 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Npas2P97460 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Npas2P97460 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npas2P97460 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Npas2P97460 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npas2P97460 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npas2P97460 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Npas2P97460 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npas2P97460 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Npas2P97460 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npas2P97460 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npas2P97460 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npas2P97460 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Npas2P97460 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npas2P97460 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npas2P97460 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Npas2P97460 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Npas2P97460 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Npas2P97460 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Npas2P97460 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms