Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nbr1P97432 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nbr1P97432 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nbr1P97432 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nbr1P97432 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nbr1P97432 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nbr1P97432 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nbr1P97432 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Nbr1P97432 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nbr1P97432 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nbr1P97432 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nbr1P97432 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Nbr1P97432 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms