Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1aP97357 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1aP97357 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf1aP97357 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms