Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkp1P97350 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkp1P97350 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkp1P97350 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkp1P97350 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pkp1P97350 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pkp1P97350 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pkp1P97350 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pkp1P97350 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkp1P97350 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pkp1P97350 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pkp1P97350 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Pkp1P97350 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pkp1P97350 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pkp1P97350 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pkp1P97350 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pkp1P97350 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pkp1P97350 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pkp1P97350 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pkp1P97350 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms