Protein–RNA interactions for Protein: P97298

Serpinf1, Pigment epithelium-derived factor, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinf1P97298 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Serpinf1P97298 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Serpinf1P97298 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Serpinf1P97298 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Serpinf1P97298 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Serpinf1P97298 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Serpinf1P97298 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Serpinf1P97298 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Serpinf1P97298 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms