Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ElocP83940 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ElocP83940 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ElocP83940 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ElocP83940 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ElocP83940 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ElocP83940 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ElocP83940 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ElocP83940 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ElocP83940 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ElocP83940 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ElocP83940 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ElocP83940 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ElocP83940 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ElocP83940 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ElocP83940 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ElocP83940 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ElocP83940 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ElocP83940 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ElocP83940 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ElocP83940 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ElocP83940 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ElocP83940 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ElocP83940 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ElocP83940 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ElocP83940 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ElocP83940 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ElocP83940 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ElocP83940 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ElocP83940 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ElocP83940 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ElocP83940 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ElocP83940 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ElocP83940 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ElocP83940 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ElocP83940 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ElocP83940 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ElocP83940 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ElocP83940 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ElocP83940 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ElocP83940 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ElocP83940 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ElocP83940 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ElocP83940 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ElocP83940 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ElocP83940 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ElocP83940 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ElocP83940 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ElocP83940 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ElocP83940 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ElocP83940 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ElocP83940 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ElocP83940 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ElocP83940 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ElocP83940 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ElocP83940 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ElocP83940 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ElocP83940 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ElocP83940 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ElocP83940 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ElocP83940 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ElocP83940 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ElocP83940 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ElocP83940 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ElocP83940 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ElocP83940 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ElocP83940 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ElocP83940 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ElocP83940 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ElocP83940 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ElocP83940 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ElocP83940 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ElocP83940 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ElocP83940 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ElocP83940 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ElocP83940 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ElocP83940 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ElocP83940 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ElocP83940 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ElocP83940 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ElocP83940 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ElocP83940 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ElocP83940 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ElocP83940 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ElocP83940 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ElocP83940 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ElocP83940 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ElocP83940 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ElocP83940 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ElocP83940 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ElocP83940 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ElocP83940 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ElocP83940 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ElocP83940 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ElocP83940 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ElocP83940 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ElocP83940 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ElocP83940 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ElocP83940 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ElocP83940 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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