Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otx1P80205 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx1P80205 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx1P80205 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx1P80205 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx1P80205 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx1P80205 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otx1P80205 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otx1P80205 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx1P80205 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx1P80205 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otx1P80205 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Otx1P80205 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx1P80205 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms