Protein–RNA interactions for Protein: P70677

Casp3, Caspase-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp3P70677 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp3P70677 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp3P70677 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp3P70677 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp3P70677 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp3P70677 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casp3P70677 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Casp3P70677 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp3P70677 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp3P70677 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp3P70677 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp3P70677 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp3P70677 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp3P70677 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp3P70677 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp3P70677 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp3P70677 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp3P70677 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp3P70677 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp3P70677 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp3P70677 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp3P70677 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp3P70677 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp3P70677 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp3P70677 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp3P70677 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp3P70677 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp3P70677 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp3P70677 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp3P70677 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp3P70677 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp3P70677 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms