Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irf3P70671 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf3P70671 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf3P70671 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf3P70671 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf3P70671 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf3P70671 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf3P70671 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf3P70671 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf3P70671 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf3P70671 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf3P70671 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf3P70671 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf3P70671 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf3P70671 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf3P70671 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irf3P70671 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irf3P70671 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf3P70671 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf3P70671 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf3P70671 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf3P70671 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf3P70671 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf3P70671 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf3P70671 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irf3P70671 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irf3P70671 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf3P70671 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf3P70671 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Irf3P70671 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf3P70671 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf3P70671 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Irf3P70671 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Irf3P70671 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Irf3P70671 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms