Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp3P70281 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sycp3P70281 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sycp3P70281 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp3P70281 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Sycp3P70281 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sycp3P70281 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp3P70281 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms