Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,95■■■■■ 5,59
Abcc9P70170 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC49,94■■■■■ 5,59
Abcc9P70170 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,94■■■■■ 5,58
Abcc9P70170 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC49,92■■■■■ 5,58
Abcc9P70170 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC49,92■■■■■ 5,58
Abcc9P70170 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,91■■■■■ 5,58
Abcc9P70170 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC49,9■■■■■ 5,58
Abcc9P70170 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC49,9■■■■■ 5,58
Abcc9P70170 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC49,9■■■■■ 5,58
Abcc9P70170 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC49,87■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,87■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC49,86■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,85■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,85■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC49,85■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49,85■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49,84■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC49,83■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC49,83■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC49,82■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,82■■■■■ 5,57
Abcc9P70170 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,81■■■■■ 5,56
Abcc9P70170 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC49,81■■■■■ 5,56
Abcc9P70170 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,81■■■■■ 5,56
Abcc9P70170 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC49,79■■■■■ 5,56
Abcc9P70170 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC49,79■■■■■ 5,56
Abcc9P70170 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC49,78■■■■■ 5,56
Abcc9P70170 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49,77■■■■■ 5,56
Abcc9P70170 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49,76■■■■■ 5,56
Abcc9P70170 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,75■■■■■ 5,55
Abcc9P70170 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC49,75■■■■■ 5,55
Abcc9P70170 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC49,74■■■■■ 5,55
Abcc9P70170 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC49,73■■■■■ 5,55
Abcc9P70170 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49,72■■■■■ 5,55
Abcc9P70170 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC49,71■■■■■ 5,55
Abcc9P70170 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,71■■■■■ 5,55
Abcc9P70170 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC49,7■■■■■ 5,55
Abcc9P70170 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC49,7■■■■■ 5,55
Abcc9P70170 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,69■■■■■ 5,54
Abcc9P70170 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,69■■■■■ 5,54
Abcc9P70170 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49,66■■■■■ 5,54
Abcc9P70170 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,65■■■■■ 5,54
Abcc9P70170 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC49,65■■■■■ 5,54
Abcc9P70170 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC49,65■■■■■ 5,54
Abcc9P70170 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC49,63■■■■■ 5,53
Abcc9P70170 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC49,62■■■■■ 5,53
Abcc9P70170 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC49,61■■■■■ 5,53
Abcc9P70170 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,58■■■■■ 5,53
Abcc9P70170 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC49,58■■■■■ 5,53
Abcc9P70170 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC49,57■■■■■ 5,53
Abcc9P70170 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC49,57■■■■■ 5,53
Abcc9P70170 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,55■■■■■ 5,52
Abcc9P70170 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,54■■■■■ 5,52
Abcc9P70170 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC49,54■■■■■ 5,52
Abcc9P70170 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC49,54■■■■■ 5,52
Abcc9P70170 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49,54■■■■■ 5,52
Abcc9P70170 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,53■■■■■ 5,52
Abcc9P70170 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,52■■■■■ 5,52
Abcc9P70170 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,5■■■■■ 5,51
Abcc9P70170 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC49,5■■■■■ 5,51
Abcc9P70170 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC49,5■■■■■ 5,51
Abcc9P70170 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC49,48■■■■■ 5,51
Abcc9P70170 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC49,46■■■■■ 5,51
Abcc9P70170 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,46■■■■■ 5,51
Abcc9P70170 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC49,45■■■■■ 5,51
Abcc9P70170 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC49,45■■■■■ 5,51
Abcc9P70170 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC49,44■■■■■ 5,51
Abcc9P70170 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,44■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,43■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC49,43■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC49,43■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,43■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,43■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,42■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC49,41■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,41■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49,41■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC49,41■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,4■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,4■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,39■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,39■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC49,38■■■■■ 5,5
Abcc9P70170 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,37■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,36■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,36■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,35■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC49,34■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,34■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC49,34■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,34■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC49,34■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC49,33■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,33■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,33■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC49,32■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC49,32■■■■■ 5,49
Abcc9P70170 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,31■■■■■ 5,48
Abcc9P70170 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49,31■■■■■ 5,48
Abcc9P70170 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC49,3■■■■■ 5,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,1 ms