Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps17P63276 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps17P63276 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps17P63276 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps17P63276 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps17P63276 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps17P63276 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps17P63276 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps17P63276 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps17P63276 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps17P63276 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps17P63276 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps17P63276 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps17P63276 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps17P63276 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps17P63276 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps17P63276 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps17P63276 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps17P63276 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps17P63276 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rps17P63276 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps17P63276 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps17P63276 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps17P63276 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps17P63276 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps17P63276 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps17P63276 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms