Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnab1P63143 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnab1P63143 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnab1P63143 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnab1P63143 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnab1P63143 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnab1P63143 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnab1P63143 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms