Protein–RNA interactions for Protein: P62932

Fbxo40, F-box only protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo40P62932 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo40P62932 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo40P62932 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo40P62932 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo40P62932 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo40P62932 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo40P62932 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo40P62932 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo40P62932 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbxo40P62932 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo40P62932 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo40P62932 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms