Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vsnl1P62761 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vsnl1P62761 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsnl1P62761 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vsnl1P62761 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vsnl1P62761 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms