Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Taf13P61216 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf13P61216 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf13P61216 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Taf13P61216 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Taf13P61216 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Taf13P61216 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf13P61216 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf13P61216 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf13P61216 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Taf13P61216 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf13P61216 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf13P61216 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf13P61216 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf13P61216 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf13P61216 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf13P61216 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf13P61216 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms