Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Eif3eP60229 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Eif3eP60229 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eif3eP60229 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Eif3eP60229 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Eif3eP60229 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms