Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup43P59235 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup43P59235 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup43P59235 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup43P59235 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup43P59235 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup43P59235 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup43P59235 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup43P59235 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup43P59235 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup43P59235 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup43P59235 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup43P59235 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup43P59235 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup43P59235 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup43P59235 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup43P59235 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup43P59235 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup43P59235 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup43P59235 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup43P59235 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup43P59235 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup43P59235 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms