Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ripk2P58801 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ripk2P58801 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ripk2P58801 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ripk2P58801 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ripk2P58801 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms