Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tpm2P58774 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm2P58774 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm2P58774 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tpm2P58774 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm2P58774 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms