Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dpf3P58269 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dpf3P58269 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dpf3P58269 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dpf3P58269 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dpf3P58269 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dpf3P58269 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms