Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lad1P57016 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lad1P57016 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lad1P57016 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lad1P57016 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lad1P57016 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lad1P57016 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lad1P57016 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lad1P57016 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lad1P57016 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lad1P57016 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lad1P57016 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lad1P57016 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lad1P57016 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lad1P57016 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lad1P57016 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lad1P57016 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lad1P57016 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lad1P57016 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lad1P57016 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lad1P57016 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lad1P57016 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lad1P57016 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lad1P57016 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lad1P57016 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lad1P57016 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lad1P57016 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lad1P57016 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lad1P57016 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lad1P57016 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lad1P57016 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lad1P57016 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lad1P57016 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lad1P57016 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lad1P57016 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lad1P57016 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lad1P57016 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lad1P57016 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lad1P57016 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lad1P57016 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms