Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox7bP56393 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cox7bP56393 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms