Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab4aP56371 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab4aP56371 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab4aP56371 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab4aP56371 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms