Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube2e3P52483 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2e3P52483 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube2e3P52483 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2e3P52483 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2e3P52483 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube2e3P52483 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube2e3P52483 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube2e3P52483 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2e3P52483 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2e3P52483 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2e3P52483 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2e3P52483 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2e3P52483 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2e3P52483 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2e3P52483 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms